Фамилия Муктарбеков образована от имени Муктарбек, представляющего собой фонетический вариант имени Мухтарбек. Оно сочетает в себе арабское прилагательное «мухтар» со значением «выбранный», «свободный, волевой» и древнетюркское существительное «бек», переводящееся как «хозяин, богатый человек». Таким образом, именование Мухтакрбек можно трактовать как «избранный бек». Вероятно, родители нарекли сына Муктарбеком, желая, чтобы он рос самостоятельным, независимым и добился высокого положения в обществе. Таким образом, потомок человека, которого звали Муктарбек, со временем получил фамилию Муктарбеков.