Фамилия Муктарбеков отвечает на вопрос «чей ты?» и указывает на прямого предка по мужской линии. Её основа — личное имя Муктарбек, которое бытует у народов, исповедующих ислам, и представляет собой фонетический вариант более распространённого имени Мухтарбек. Замена глухого «х» на звонкий «к» в начале слова — типичная черта живой устной речи, где звук упрощается для лёгкости произношения.

Имя это составное, и в нём сплелись две культурные традиции. Первая часть восходит к арабскому прилагательному «мухтар» — «выбранный», «избранный», а вторая — к древнетюркскому титулу «бек» (в иных формах «бий», «бай»), который обозначал хозяина, предводителя, богатого и уважаемого человека. Соединившись, эти части дают значение «избранный бек» — то есть не просто знатный, но выделенный, отмеченный свыше.

Вряд ли родители, нарекая сына Муктарбеком, задумывались о буквальном переводе. Скорее они вкладывали в имя пожелание: пусть мальчик вырастет самостоятельным, волевым, добьётся уважения и высокого положения в обществе, будет хозяином своей судьбы. Такая модель имянаречения — с пожеланием богатства и знатности — была широко распространена в тюркоязычной среде, и Муктарбек здесь звучит как своего рода благословение на достойную жизнь.

Сама фамилия сложилась по классической для русской ономастики модели: к восточному имени добавили русский патронимический суффикс -ов, который изначально означал принадлежность роду. То есть Муктарбеков — это буквально «сын Муктарбека», «из рода Муктарбека». Такое оформление характерно для фамилий, которые фиксировались у тюркских и кавказских народов в период их вхождения в состав Российской империи, когда имена и прозвища адаптировались под русские грамматические нормы.

Стоит заметить, что фамилия эта довольно редкая и несёт яркий отпечаток региона своего происхождения — скорее всего, Средней Азии, где имена с компонентом «бек» особенно частотны. В отличие от фамилий, образованных от прозвищ или профессий, она напрямую сохранила память о конкретном человеке — родоначальнике, который носил это гордое имя.