Фамилия Мукурова — женская форма от Мукуров, и её разбор стоит начать с неочевидного корня. Основа «мукур» в русском языке не встречается ни как нарицательное слово, ни как древнерусское имя. Это сразу указывает на заимствование. Скорее всего, фамилия тюркского происхождения, и её основа восходит к слову «мукур» или «мокур» — в ряде тюркских языков (например, в казахском, башкирском, татарском) так называют крота. Прозвище Мукур могли дать человеку за схожесть с этим зверьком: невысокому, коренастому, с привычкой копаться в земле или, напротив, за скрытный, «подземный» образ жизни. Иногда прозвище давали и землекопу — тому, кто копал колодцы или рыл канавы.

Суффикс «-ов» указывает на типично русскую модель образования фамилий от прозвищ или имён. В данном случае он прикрепился к тюркской основе, что говорит о смешанной среде: предок носителя фамилии мог быть крещёным татарином, башкиром или казахом, перешедшим в русское сословие, или же русским, получившим прозвище от соседей-тюрков. Фамилия фиксируется в основном в регионах Поволжья, Приуралья и Западной Сибири — там, где веками жили тюркские и славянские народы бок о бок.

Менее вероятная, но допустимая версия связывает «мукур» с диалектным глаголом «мукурить» — в некоторых говорах так говорят о том, кто делает что-то неспешно, возится, «мудрит». Тогда Мукур — прозвище медлительного или чересчур дотошного человека. Однако эта гипотеза слабее, так как сам глагол редок и плохо засвидетельствован в словарях.

Сословная принадлежность Мукуровых — скорее всего, крестьянская или казачья. Фамилия не встречается в родословных книгах дворянства, и её носители не оставили заметного следа в истории до XX века. В советское время фамилия стала известна благодаря, например, спортсменке Марине Мукуровой, выступавшей за Казахстан в лёгкой атлетике, что косвенно подтверждает тюркский след.

Таким образом, фамилия Мукурова — это «зоологическое» прозвище, перешедшее в русскую фамилию на стыке культур. Её носитель — потомок человека, которого за глаза называли Кротом.