Фамилия Мулидонян — почти наверняка армянская, хотя её основа неочевидна и не поддаётся однозначному переводу с первого взгляда. Армянский фамильный суффикс -ян (в старой орфографии -янц) означает «из рода кого-то» или «принадлежащий». Это самая распространённая модель армянских фамилий, аналогичная русским окончаниям -ов/-ев, -ин. Таким образом, Мулидонян — это «потомок Мулидона» или «из семьи Мулидона».

Сложность в корне — «Мулидон». Это не армянское имя в привычном понимании, не календарное и не древнее языческое. Скорее всего, это фамильное прозвище или переосмысленное заимствование. Есть две основные версии происхождения.

Первая: «Мулидон» — это искажённое или диалектное произношение имени «Мелитон» (от греческого «мели» — мёд). Имя Мелитон было известно в армянской среде, особенно среди григориан. В народной речи оно могло превратиться в Мулидон: «е» под ударением перешло в «у» (как в диалектах: «мед» — «муд»), а конечное «-он» возникло под влиянием других имён (например, Артаваздон). Тогда Мулидонян — это «потомок Мелитона».

Вторая версия: связь с тюркским или персидским словом, означающим «мулла» (духовное лицо, грамотей). В армянском языке есть слово «мулла» (մուլլա), а суффикс -дон мог быть добавлен для образования прозвища («тот, кто при мулле» или «муллин сын»). Однако такое словообразование для армянского нехарактерно — чаще используют просто «Муллаян». Поэтому эта версия слабее, хотя и возможна в зоне смешения культур (например, в Нахичевани или Карабахе).

Географически фамилия редкая. В современной Армении и в диаспоре (особенно в Краснодарском крае и Ростовской области) встречаются единичные носители. Нет данных о том, что Мулидоняне принадлежали к какому-то одному сословию — это могла быть и крестьянская, и ремесленная фамилия. Скорее всего, она возникла в XIX веке, когда армянам массово присваивали фамилии по отцу или прозвищу.

Если ваши предки — Мулидоняне, то, вероятно, они происходят из западной или центральной Армении (историческая область Васпуракан или Тарон), где греческие имена были в ходу. Точнее сказать можно было бы только при наличии семейного предания или старого написания (до реформы орфографии 1922 года).