Фамилия Мунянова — женская форма фамилии Мунянов, и чтобы понять её происхождение, нужно разобрать мужской вариант. Основа здесь — «Мунян», и это редкий случай, когда фамилия образована не от полного крестильного имени, а от его краткой, разговорной или диалектной формы.

Скорее всего, в основе лежит имя Мануил (или более редкое Иммануил). В народной речи это имя часто сокращали и переделывали: Мануила могли звать Маня, Манюня, а от «Манюня» уже легко получить «Муня» и ласкательное «Мунян». Суффикс «-ан» в русских прозвищах и именах (как Иван, Степан, или уменьшительные — Петрян, Степан) усиливает значение: «Мунян» — это «маленький Муня» или «сын Муни». То есть фамилия могла означать «потомок того, кого звали Муня».

Есть и другая, менее вероятная версия. В тюркских языках (татарском, башкирском) существует слово «мун» — «печаль, тоска», а «мунян» могло быть прозвищем человека задумчивого или грустного. Однако для русской фамилии такая основа нехарактерна, и если предки Муняновых не были крещёными татарами или башкирами, эта версия — лишь догадка. Фонетически фамилия звучит по-русски, и имя Мануил даёт более прямое и логичное объяснение.

Суффикс «-ов» указывает на принадлежность: Мунянов — «чей?» — «сын Муняна». Встречается такая фамилия в основном в центральной России и Поволжье, где имя Мануил было в ходу среди крестьян и мещан. Носительница фамилии Мунянова может с высокой долей вероятности вести свой род от человека, которого в быту звали ласково Муня или Мунян — скорее всего, от имени Мануил.