Фамилия Мураткалиева — женская форма фамилии Мураткалиев, и её разумно начинать с разбора мужского варианта, так как именно он хранит ключ к происхождению. Это типичная фамилия тюркского ареала, образованная по русской патронимической модели с помощью суффикса -ев, который присоединили к основе Мураткали.

В основе лежит двусоставное личное имя Мурат-Кали (или Мураткали). Первая часть — Мурат (араб. «желанный», «цель», «намерение») — распространённое у тюркских и кавказских народов имя, восходящее к арабскому Мурад. Вторая часть — Кали — сокращение от Калим или Абдулкалим (араб. «говорящий», один из эпитетов пророка Мусы в исламской традиции). Таким образом, имя Мураткали — это композит, где обе части несут смысл «желанный» и «говорящий», либо имя, данное в честь предка по имени Кали.

Географически фамилия Мураткалиев/Мураткалиева тяготеет к регионам, где сильно влияние казахской, башкирской или татарской антропонимии: это Казахстан, Оренбургская, Челябинская, Астраханская области России. Встречается она и у ногайцев, и у каракалпаков. Сложносоставные имена с компонентом «Кали» характерны именно для мусульманских народов Поволжья и Центральной Азии, где имя Калим (или его стяжённая форма) часто выступало второй частью двусоставного имени.

Что касается социального статуса, то фамилии на -ев, образованные от полных имён, в тюркской среде часто получали грамотные слои населения — муллы, старшины, торговцы, а также казаки, если речь о яицких или оренбургских казаках тюркского происхождения. Но однозначно утверждать, что предок носителя фамилии был духовным лицом или воином, нельзя: имя могло быть просто личным, без сословной привязки.

Интересная деталь: написание через «а» (Мураткалиев) отличает эту фамилию от похожей, но другой — Муртазалиев, где корень «Муртаза» («избранный»). Путаница между ними редка, но встречается, особенно в устной речи. Фамилия Мураткалиева вряд ли старше XVIII века — именно тогда у тюркских народов Российской империи начали массово фиксироваться фамилии по русскому образцу.