Фамилия Мураткалиев происходит от восточного имени Мураткали, которое чаще всего считают вариантом более полного имени Муратгали. Первая часть этого составного имени восходит к арабскому Мурат со значением «цель, намерение, желание» или «желанный». Вторая часть — Гали — один из эпитетов Аллаха; в переводе на русский она означает «великий, возвышенный, высший», а также «могучий, сильный, превосходящий всех».

Соединение двух таких основ давало имя-пожелание: родители, называя сына Муратгали, вкладывали в него надежду, что мальчик вырастет человеком, который добьётся своей цели и будет обладать высоким положением. Фамилия, таким образом, означает «потомок Мураткали» и отвечает на вопрос «чей ты?». Модель с суффиксом -ев здесь типична для тюркских фамилий, которые оформлялись по русскому образцу притяжательных прилагательных.

В документах начала XX века встречается носитель этой фамилии — Мураткалиев Сейл, родившийся в Актюбинской области и записанный казахом. Эта географическая привязка не случайна: составные имена с компонентом Мурат и Гали широко бытовали у казахов и других тюркских народов, а фамилии от них закреплялись в основном в среде оседлого населения, когда началась массовая фиксация родовых имён.

Интересно, что написание Мураткалиев закрепилось в русской передаче, хотя в самой тюркской среде имя чаще звучало как Муратқали. Буква «к» в середине — следствие адаптации к русской графике, где сочетание «тг» читалось бы иначе. Поэтому фамилию стоит воспринимать не как искажение, а как естественный результат межъязыкового переноса.