Фамилия Мусабек звучит непривычно для русского уха, но её происхождение прозрачно для тех, кто знаком с тюркскими языками и мусульманской культурой. Это составное имя, где первая часть — арабское «Муса» (араб. موسى, библейский Моисей), а вторая — тюркское «бек» (титул, означающий «господин», «князь», «вождь»). Получается «Муса-господин» или «господин, подобный Мусе».

Модель образования здесь не русская, а восточная: сложение двух значимых компонентов без суффикса. В русской среде такие фамилии не образовывали — их приносили с собой переселенцы из Средней Азии, с Кавказа или из Поволжья. В отличие от русских фамилий на -ов или -ин, Мусабек не меняет форму: это «несклоняемая» фамилия, что сразу выдаёт её инородное происхождение.

Вероятнее всего, фамилия возникла как личное имя или прозвище у народов, где титул «бек» был распространён: у казахов, узбеков, азербайджанцев, татар или народов Дагестана. Имя Мусабек давали мальчикам в честь пророка Мусы (Моисея), подчёркивая уважение к нему и желая ребёнку достоинства. Позже это имя закрепилось за родом и стало фамилией — типичный процесс для многих тюркских и кавказских культур, где наследственные фамилии появились позже, чем в России.

Встречаются и альтернативные версии: иногда «Муса» могло быть не библейским именем, а частью древнего тюркского имени с другим значением, но это менее вероятно. Арабское влияние в исламском мире было настолько сильным, что имя пророка — самый надёжный источник.

Носители фамилии Мусабек сегодня живут в основном в странах СНГ: в Казахстане, Узбекистане, Азербайджане, а также в татарских и дагестанских общинах России. Встречаются и в русскоязычной среде, куда фамилия попала через миграцию. Сословно предки могли быть и знатными (если «бек» означал реальный титул), и простыми людьми, получившими имя как пожелание благородства — точных данных без генеалогического поиска нет.