Фамилия Муштанова образована от прозвища Муштан, и вопрос о её происхождении не так прост, как кажется на первый взгляд. В ономастике редко встречается единственно верное толкование, и здесь мы имеем как минимум три версии, каждая из которых по-своему интересна.

Наиболее вероятной выглядит восточная гипотеза. Прозвище Муштан могло восходить к киргизскому глаголу «мушта» («наносить удар») или к узбекскому слову «мушт» («кулак»). В этом случае прозвище относится к разряду «профессиональных» именований и указывает на род занятий предка: вполне вероятно, что основатель рода был сильным воином или бойцом, чья сила и мастерство стали его визитной карточкой. Такое прозвище могли дать человеку, который выделялся в бою или кулачных забавах.

Вторая версия связывает прозвище с географическим названием. Муштан мог получить выходец из деревни Мушта, которая, согласно некоторым источникам, располагалась в Киргизской волости. Подобная модель, когда переселенца называли по месту прежнего жительства, очень распространена в русской фамильной традиции. В этом случае фамилия хранит память не о чертах характера, а о малой родине предка.

Существует и третья гипотеза, которая выводит прозвище из русского глагола «муштать» — «знать, понимать». Если принять эту версию, то основатель рода Муштановых был человеком умным и сообразительным, а прозвище закрепилось за ним как признание его сметливости. Эта версия менее убедительна, поскольку глагол «муштать» в русских говорах встречается редко, но полностью исключать её нельзя.

Сам по себе суффикс -ан в прозвище Муштан типичен для русской народной антропонимии: он придаёт слову оттенок просторечия и фамильярности, часто указывая на носителя яркого качества. Потомок человека по прозвищу Муштан со временем получил фамилию Муштанова — так обычное прозвище превратилось в родовое имя, которое по сей день хранит память о происхождении человека. Какая из трёх версий верна для конкретной семьи, сегодня сказать трудно, но каждая из них по-своему рисует портрет далёкого предка: воина, переселенца или мудреца.