Фамилия Ммуштакова — редкий случай в русской ономастике, где написание с двойной «м» в начале бросается в глаза. Скорее всего, перед нами результат поздней фиксации или искажения при записи: в документах могли сдвоить первую букву по ошибке или под влиянием нерусского произношения. Если отбросить вторую «м», получится форма Муштакова, которая уже вписывается в знакомую словообразовательную модель.

Основа фамилии — прозвище или нецерковное имя Муштак. В русских говорах слово «муштак» означало маленькую лошадку, пони или вообще коня низкорослой породы. Такое прозвище могли дать человеку невысокого роста, коренастому или обладателю какой-то лошадиной черты — например, силе или упрямству. Реже «муштак» связывают с диалектным глаголом «муштать» — бить, колотить, откуда прозвище могло перейти на драчуна или задиру.

Суффикс «-ов» в форме Муштаков указывает на типичную русскую патронимическую модель: «чей?» — Муштаков, то есть сын или потомок Муштака. Окончание «-а» в женском варианте фамилии — грамматический признак рода, а не отдельная ветвь. Таким образом, Ммуштакова — это женская форма от фамилии Ммуштаков, которая, в свою очередь, восходит к исходному Муштаков.

Географически фамилия Муштаков встречается в южнорусских и поволжских регионах, особенно среди казачества, где прозвища по конской масти или стати были обычны. Двойное «м» в начале могло возникнуть при переписи в XX веке, когда писарь неверно расслышал или записал фамилию с усилением первого звука. Встречаются и единичные случаи, когда носители сознательно сохраняют удвоение как семейную особенность, но это скорее исключение.

По социальному происхождению носители фамилии Муштаковы чаще всего относились к крестьянам или казакам — сословиям, где прозвища, связанные с хозяйством и животными, были особенно распространены. Дворянских родов с такой фамилией в официальных родословных книгах не зафиксировано.