Фамилия Мустайкина хранит память о личном имени предка — Мустайка. Это уменьшительно-ласкательная форма арабского имени Мустафа, которое переводят как «избранный», «самый чистый», «превосходящий других». Имя давали с пожеланием, чтобы ребёнок выделялся лучшими качествами, был достоин уважения. От той же основы образованы фамилии Мустафин, Мустаев, Мустайкин — все они восходят к одному корню, но разошлись по разным ветвям рода.

Форма Мустайка особенно прижилась у финно-угорских народов Поволжья — у мордвы, марийцев, отчасти у удмуртов. Это не случайно: имя пришло вместе с исламской традицией, но в иноязычной среде его переделали на свой лад, добавив ласкательный суффикс. Так арабское имя приобрело местное звучание и стало привычным для крещёных народов края.

Модель образования фамилии простая и древняя: к основе Мустайк- добавили суффикс -ин, который указывает на принадлежность. В русской традиции фамилии на -ин обычно возникали от имён или прозвищ, оканчивающихся на -а/-я. Сын Мустайки становился Мустайкиным, его дети наследовали это прозвание, и со временем оно закрепилось как фамилия.

Фамилия Мустайкина несёт в себе сразу два культурных пласта. С одной стороны, это арабское имя с высоким смыслом, с другой — местная, поволжская огранка, которая делает фамилию узнаваемой именно в этом регионе. По фамилии можно предположить, что предки носителей жили на стыке культур, где русские, тюркские и финно-угорские влияния переплетались веками.

В написании фамилия устойчива: Мустайкин — для мужчин, Мустайкина — для женщин. Ударение, как правило, падает на второй слог: Мустáйкин. В документах встречаются варианты Мустайкиной, Мустайкину — это обычные падежные формы, а не отдельные фамилии.