Фамилия Мустжаце — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, не поддаётся однозначной славянской этимологии. Скорее всего, перед нами фамилия тюркского или балтийского происхождения, адаптированная русским языком. Если отталкиваться от тюркских корней, то первая часть — «муст» — может восходить к слову «муста» (усы) или «мустафа» (избранный). Вторая часть — «жаце» — могла быть искажённым «джа» или «дже», что в тюркских языках часто означает «душа» или служит уменьшительным суффиксом. В таком случае фамилия могла означать «усатый» или «тот, кто с усами» — прозвище, данное по яркой внешней примете.

Другая, не менее вероятная версия — балтийское происхождение. В латышском языке есть слово «musts» (ус) и суффикс «-ace», образующий фамилии. Фамилия Мустжаце могла возникнуть на стыке латышского и славянского влияния, например, в Латгалии или на западе Псковской области. В таком случае основа та же — «усатый», но оформление уже балтийское.

Словообразовательная модель необычна: фамилия не имеет стандартных русских суффиксов (-ов, -ин, -ский). Она оканчивается на «-це», что характерно для полонизированных или литовских фамилий (ср. Баранауце, Кавальце). Это указывает на то, что носитель фамилии мог происходить из западнорусских земель, где смешивались славянские, балтийские и тюркские элементы.

Географически фамилия Мустжаце встречается крайне редко. Основной ареал — западные регионы России (Псковская, Смоленская области) и восток Латвии. В дореволюционных источниках такая фамилия могла принадлежать крестьянам или мещанам, но из-за редкости точных данных о сословной принадлежности нет.

В ономастических справочниках фамилия не описана, что подтверждает её локальный и, возможно, недавний характер. Вероятнее всего, предок носителя получил прозвище по внешности — за густые усы, которые в крестьянской среде считались признаком зрелости и мужественности.