Фамилия Муянов — редкий случай, где географический ключ важнее морфологического. В ней слышен отчётливый тюркский субстрат, и почти наверняка её основа — не русское имя или прозвище, а тюркское мужское имя Муян.

Имя Муян (варианты — Муян, Муюн) распространено у башкир, татар, казахов. Его прямое значение — «шея», но в переносном смысле так могли назвать человека с длинной или, наоборот, короткой и крепкой шеей. В ономастике тюркских народов такие «телесные» имена не редкость: они служили оберегом или просто фиксировали внешнюю примету. Суффикс -ов в фамилии Муянов — типичный русский патронимический формант, который присоединялся к тюркским основам при переходе на русскую модель именования в XVIII–XIX веках. То есть Муянов буквально означает «сын Муяна» или «потомок Муяна».

Есть и вторая, менее вероятная версия. В некоторых тюркских диалектах «муян» может означать «бедняк», «нуждающийся». Если это так, то фамилия происходит от прозвища по социальному положению. Однако для прозвищ такого типа чаще использовали слово «факыр» или «ярлы», так что версия с именем выглядит убедительнее.

Географически фамилия Муянов тяготеет к Башкортостану, Татарстану и Оренбургской области. Встречается она и у казахов, но там чаще пишется как Муянов или Муянулы. В русских переписных книгах и ревизских сказках XVIII–XIX веков эта фамилия фиксируется в среде тептярей и башкир-вотчинников, что подтверждает её тюркское происхождение.

По сословной принадлежности предки Муяновых, скорее всего, были государственными крестьянами или казаками. Дворянских родов с такой фамилией в «Бархатной книге» и «Общем гербовнике» нет — это фамилия не аристократическая, а народная, что делает её типичным примером поздней русской фамилии, возникшей на стыке культур.