Фамилия Музенитова образовалась под влиянием нескольких национальностей. Она встречается в предгорьях Кавказа и, вероятно, представляет собой русифицированную греческую фамилию Музениди. По одной из версий, фамилия Музениди образована от названия некой местности Музен. В пользу этой гипотезы может говорить наличие арабской «топонимической» фамилии аль-Музени, по-видимому, связанной с тем же названием. Таким образом, буквально Музениди может означать «выходец из местности Музен». Согласно другой гипотезе, в основе этой фамилии лежит древнее грузинское имя Мусини, которое в переводе означает «революционер». Наконец, фамилия Музениди могла быть образована от греческого корня μύζω – «издавать звуки, подобные мычанию, стонать». Следовательно, основатель рода Музенитовых мог отличаться манерой речи.