Фамилия Музенитова — редкий случай, когда в одной русской фамилии переплелись следы сразу нескольких культур. Встречается она в предгорьях Кавказа, и это географическое указание — ключ к разгадке. Скорее всего, перед нами русифицированная греческая фамилия Музениди, которую адаптировали под русскую словообразовательную модель, добавив суффикс -ов. Такую же трансформацию прошли многие греческие фамилии на -иди/-ди, когда их носители оказывались в русскоязычной среде.

Самая правдоподобная версия происхождения исходной фамилии Музениди — топонимическая. Она могла образоваться от названия местности Музен. В пользу этого говорит существование арабской «топонимической» фамилии аль-Музени, которая, по-видимому, связана с тем же корнем. Если так, то буквально Музениди означает «выходец из местности Музен», то есть предок носителей фамилии был человеком, который переселился оттуда и получил прозвище по месту прежнего жительства.

Есть и другие гипотезы, хотя они выглядят менее убедительными. Одна из них возводит фамилию к древнему грузинскому имени Мусини, которое переводят как «революционер». Другая — к греческому корню μύζω («издавать звуки, подобные мычанию, стонать»). В этом случае основатель рода Музенитовых мог получить прозвище за манеру речи — например, за низкий, гулкий голос или привычку говорить с придыханием.

Если опираться на сравнительную ономастику, топонимическая версия выглядит предпочтительнее. Она объясняет и форму без суффикса -ини, и наличие параллельной фамилии в арабской среде. Версия с грузинским именем «революционер» сомнительна хотя бы потому, что слово «революционер» в древнегрузинском языке — анахронизм, такое значение не могло закрепиться за личным именем столетия назад. Греческая версия со «стонать» возможна, но прозвища по манере речи встречаются реже, чем указания на место выхода, поэтому она уступает первой.

Что касается русской формы: суффикс -ов в фамилии Музенитова — стандартный способ адаптации иноязычной основы. Он указывает на принадлежность роду, то есть буквально «дочь (или жена) Музенита». Сама форма Музенит — промежуточное звено, которое возникло при обрусении исходного Музениди. Так что носительница фамилии Музенитова может считать себя наследницей греческих переселенцев, чьи предки когда-то покинули местность Музен и осели на Кавказе.