Фамилия Мяльдзина звучит непривычно для русского уха, что сразу наводит на мысль о её нерусском происхождении. Скорее всего, перед нами пример фамилии, возникшей на стыке культур, и её корни ведут в Прибалтику или в финно-угорскую среду северо-запада России. Основа «Мяльдз-» почти наверняка восходит к эстонскому или финскому слову «mäld» (ум, разум, память) или к его диалектным вариантам. В эстонском языке есть слово «mäletama» — помнить, а «mälu» — память. Таким образом, прозвище Мяльдь (или Мяльдз) мог получить человек памятливый, рассудительный или, напротив, тот, кого считали «себе на уме».

Суффикс «-ин» в данном случае не является типичным русским патронимическим суффиксом от имени на -а, а скорее выполняет роль русификатора. Когда носители прибалтийских или финских фамилий попадали в русскую языковую среду, их фамилии часто адаптировали, добавляя к основе русские окончания. Мяльдзина — это женская форма, мужской вариант — Мяльдзин. Словообразовательная модель проста: к основе Мяльдз- прибавили суффикс принадлежности «-ин», что буквально значит «чей?» — «человек из рода Мяльдзя».

Географически фамилия должна быть привязана к территориям, где исторически жили эстонцы, сету, ижора или водь: Псковская область, Ленинградская область, Эстония. Встречаются единичные упоминания фамилии в метрических книгах XIX века по Санкт-Петербургской губернии, что подтверждает версию о миграции крестьян из Прибалтики. Внутри России фамилия крайне редкая, её носители, скорее всего, потомки тех, кто перебрался в центральные губернии в ходе столыпинской реформы или после Великой Отечественной войны.

Есть и менее вероятная версия, которую стоит упомянуть лишь для полноты. В некоторых говорах русского Севера (Архангельская, Вологодская области) бытовало слово «мяль» — мягкая, вязкая глина, а также «мяльдовать» — месить, мять. В этом случае прозвище Мяльдзя могло относиться к гончару или просто к человеку с мягким, податливым характером. Но эта версия слабее, так как суффикс «-дз» нетипичен для русских прозвищ, а в прибалтийских языках он встречается регулярно. Таким образом, наиболее вероятно, что предки носительницы фамилии Мяльдзина были эстонцами или представителями малых финно-угорских народов, получившими прозвище по черте характера, а затем русифицировавшими свою фамилию.