Фамилия Мытыпова — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Её основа «Мытып-» не встречается в списках распространённых русских имён, прозвищ или профессий, поэтому ключ к разгадке лежит не в славянской, а в тюркской ономастике. Скорее всего, фамилия образована от личного имени или прозвища Мытып, которое, в свою очередь, восходит к тюркскому корню со значением «прочный», «крепкий» или «устойчивый». В некоторых тюркских языках (например, в казахском, татарском, башкирском) схожие основы дают имена с пожеланием твёрдости характера или физической выносливости.

Суффикс «-ов» указывает на стандартную русскую модель образования фамилий от отчества: Мытып → сын Мытыпа → Мытыпов. Окончание «-а» — это женская форма, то есть Мытыпова — «дочь/жена Мытыпа». Такая модель массово закрепилась в XIX веке, когда крестьянам и инородцам (нерусским народам) приписывали фамилии по отцу. Географически фамилия могла возникнуть в зоне контакта русских и тюркских народов — в Поволжье, на Урале, в Сибири или в казахских степях, где фиксация тюркских имён в русских документах давала такие гибридные формы.

Есть и более редкая версия, которую нельзя сбрасывать со счетов: основа могла быть искажена при записи. В приказных избах и волостных правлениях писцы нередко коверкали непривычные звуки, и исходное имя вроде Мытып (или Матып, Мытап) могло на самом деле звучать иначе. Например, в татарском языке есть имя Мәтәү (Мәтәү) с неясной этимологией, которое при русификации могло дать форму Мытыпов. Без письменных источников XVII–XVIII веков точный корень восстановить сложно, но тюркское происхождение остаётся самым надёжным объяснением.

Сословно носители фамилии Мытыпова, скорее всего, относились к крестьянам или казакам, реже — к мещанам. Дворянских родов с такой фамилией в исторических справочниках не зафиксировано. Сегодня фамилия встречается крайне редко, преимущественно на юге России и в Казахстане, что подтверждает её региональную привязку к тюркоязычной среде.