Фамилия Надводнюк образована от прозвища Надводный. В словаре Владимира Даля прилагательное «надводный» трактуется как «находящийся над поверхностью воды; плавающий по поверхности воды» — в применении к судам и флоту. Отсюда прямой шаг к версии, что прозвище относилось к «профессиональным» именованиям и указывало на род занятий предка: скорее всего, основатель рода Надводнюк был моряком или имел отношение к флоту.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: к основе Надводн- добавлен украинский патронимический суффикс -юк, который в западных и юго-западных регионах Украины играл ту же роль, что русские -ов и -ин. Он отвечал на вопрос «чей сын?» и означал «сын Надводного» или «потомок Надводного». Такая модель типична для Волыни, Подолья и Полесья, что позволяет предполагать западноукраинское происхождение фамилии, хотя само прозвище могло сложиться и в русской языковой среде.

Любопытно, что прозвище Надводный могло иметь и второе, менее очевидное прочтение. В говорах «надводным» иногда называли человека, живущего у самой воды, на берегу реки или озера, — не обязательно моряка. Но версия о морской профессии выглядит правдоподобнее: фамилия с таким корнем редка, и её носители, вероятно, происходят из семей, где связь с водой была не бытовой, а профессиональной.

Прозвище Надводный, изначально присоединённое к наследственному имени, со временем полностью заменило его — сначала в повседневной жизни, затем и в официальных документах. Так наследственное имя уступило место прозвищу, которое точнее описывало человека и его дело. Фамилия Надводнюк — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не черта характера и не ремесло в чистом виде, а скорее образ, связанный с водной стихией и флотом.