Фамилия Накиднев — редкий случай, когда в основе лежит не профессия, не имя и не географическое название, а, скорее всего, бытовое прозвище, связанное с действием. Её структура прозрачна: корень «накид-», суффикс «-н-» и окончание «-ев», указывающее на принадлежность («чей?» — сын Накидня). Такой суффиксальный ряд («накид-н-ев») встречается нечасто; чаще фамилии образуются сразу от корня с помощью -ов/-ев (например, Накидов). Здесь же мы видим промежуточную форму — прозвище Накидень.

Самая прямая версия связывает фамилию с глаголом «накинуть» или «накидать». Прозвище Накидень могли дать человеку по манере поведения: например, тому, кто быстро, «накидывал» на себя одежду, работал торопливо, или, напротив, тому, кто любил накидывать на плечи плащ, накидку. В говорах «накидень» могло означать и предмет — накидку, верхнюю одежду. Тогда прозвище переходило на человека, который такую одежду шил или носил. Менее вероятна, но возможна связь с «накидать» в смысле «набросать, сложить в кучу» — так могли прозвать работника, занятого скирдованием сена или укладкой дров.

С географической точки зрения фамилия тяготеет к южнорусским и украинским землям. Формант «-ев» вместо «-ов» здесь закономерен: он появляется, когда основа оканчивается на мягкий согласный или «й» (Накидень → Накиднев). Встречаемость фамилии невысока; в дореволюционных переписях она фиксировалась в основном в Воронежской, Курской и Харьковской губерниях. Это косвенно подтверждает, что прозвище возникло в среде крестьян или однодворцев — людей, чьи фамилии часто отражали конкретную черту внешности или бытовую привычку, а не сословный статус.

Однокоренных фамилий немного: Накидов, Накидкин, Накидный. Все они образованы от той же основы, но с разными суффиксами, что говорит о параллельном бытовании прозвища в разных диалектных зонах. В словаре Б. Унбегауна фамилия не упоминается, что характерно для локальных, нераспространённых образований. Исследователь В. Никонов относил подобные «глагольные» фамилии к числу поздних — они закреплялись за крестьянами уже после отмены крепостного права, когда прозвище могло стать официальной фамилией без изменений.

Таким образом, Накиднев — фамилия-характеристика. Предок носителя, скорее всего, получил её за манеру одеваться или за специфику работы, связанной с набрасыванием, накидыванием чего-либо. Спорных версий здесь нет, и самая правдоподобная — бытовая, от глагола «накинуть».