Фамилия Накупов — редкий пример, где корень указывает не на профессию или внешность, а на конкретное бытовое действие. В её основе лежит глагол «накупать» — делать покупки, приобретать товар в большом количестве или вскладчину. Прозвище Накуп могли дать человеку, который занимался оптовыми закупками для общины, был купчиной или торговал на ярмарках. В русских говорах слово «накуп» означало также «покупка» или «скупка», поэтому предок мог быть скупщиком сельскохозяйственной продукции, льна, пушнины.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую модель образования фамилий от прозвищ или имён, оканчивающихся на твёрдый согласный. Формально это притяжательное прилагательное: «чей?» — Накупов, то есть сын или потомок человека по прозвищу Накуп. В отличие от фамилий на -ин, которые чаще образуются от основ на -а/-я, здесь мы видим классическую патронимическую схему, распространённую в центральной и северной России.

Интересно, что фамилия Накупов не связана с крестильным именем — в святцах нет ничего похожего. Это чисто прозвищная фамилия, причём довольно узкой семантики. В ономастических справочниках она не упоминается, что говорит о её локальном бытовании — скорее всего, в Поволжье или на Урале, где были развиты ярмарочная торговля и отходничество. Версия о тюркском происхождении (например, от «накуп» как искажённого «накиб» — старшина) маловероятна, поскольку в русских говорах глагол «накупать» зафиксирован повсеместно, а суффикс -ов типичен именно для славянских фамилий.

Сословная принадлежность носителей фамилии могла быть разной: от крестьян, подрабатывавших скупкой, до купцов и мещан. Но поскольку фамилия редкая и не попала в дворянские родословные книги, скорее всего, её носили крестьяне или посадские люди. В советское время фамилия могла утратить связь с исходным значением, но для этимолога она остаётся яркой иллюстрацией того, как хозяйственная деятельность человека закреплялась в родовом имени.