Фамилия Налогина хранит память о прозвище дальнего предка — Налога. Это прозвище, в свою очередь, связано с понятием тяжелой работы и усилия. В «Толковом словаре живого великорусского языка» Владимира Даля слово «налога» означает «труд, тягость, тяжелая работа». Скорее всего, так в народе называли человека, который занимался изнурительным физическим трудом и был известен своей выносливостью.

Существует и другая версия происхождения. В основе прозвища могло лежать слово «налог» — государственный сбор, который взимали с населения. Тогда Налогой называли сборщика податей, и прозвище относилось к разряду «профессиональных» именований, указывающих на род занятий. Эта версия правдоподобна, но менее вероятна: прозвища от названий тяжелой работы встречаются чаще, чем от названий фискальных должностей.

Третья гипотеза отсылает к диалектному прилагательному «наложный». В новгородских и вологодских говорах оно значит «работящий, усердный». Если принять эту версию, то прозвище Налога закреплялось за трудолюбивым и старательным человеком, которого ценили за усердие в делах.

Фамилия образована по типичной русской модели с суффиксом -ин, который присоединялся к основам на -а. Так от прозвища Налога возникла фамилия Налогин, а женская форма Налогина указывает на принадлежность к этому роду по женской линии. Подобная модель широко распространена в северных и центральных русских говорах, где прозвищные фамилии часто вытесняли крестильные имена.

Какую из версий ни принять, ясно одно: прозвище Налога не было обидным или случайным. Оно подчеркивало либо тяжелую долю человека, либо его усердие и силу. Со временем прозвище закрепилось как основное именование, а затем легло в основу фамилии, которая по сей день связывает носителей с трудолюбивым предком.