Фамилия Намдыков — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все прочие версии происхождения. Её основа — Намдык — с высокой вероятностью восходит к калмыцкому мужскому имени Намдык, которое, в свою очередь, происходит от тибетского «намдак», что означает «чистый», «святой» или «безупречный». В буддийской традиции, распространённой среди калмыков и бурят, такие имена давали с пожеланием нравственной чистоты и духовного совершенства.

Модель образования фамилии проста и прозрачна: к основе Намдык добавлен русский патронимический суффикс -ов, который в данном регионе закрепился в результате административного учёта населения в XIX — начале XX века. Калмыцкие и бурятские родовые имена, попадая в русские документы, часто оформлялись именно так — по отцу. Поэтому Намдыков буквально означает «сын Намдыка» или «потомок Намдыка».

Интересно, что в отличие от многих фамилий, где можно спорить о тюркском или монгольском корне, здесь вариант славянской этимологии практически исключён. Слово «намдык» не имеет значений в русских говорах и не встречается в древнерусских прозвищах. Это делает фамилию чётким маркером происхождения из среды ойратов (калмыков) или бурят, где подобные имена были обычны в среде лам и мирян.

Сравните с однокоренными фамилиями: Намдыков и Намсараев — обе построены по одной модели от тибетско-монгольских имён, но вторая чаще встречается у бурят, а первая — у калмыков. Встречаемость фамилии Намдыков в целом невысока, она сосредоточена в Калмыкии, а также в среде калмыцкой диаспоры. Социальный слой предков — скорее всего, скотоводы или крестьяне, получившие фамилию по отцу при переписях, но не исключено, что основатель рода был связан с буддийским духовенством, где имя Намдык особенно почиталось.