Фамилия Намитов — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она образована от прозвища или мирского имени Намит, которое, в свою очередь, восходит к тюркскому слову «намит» — «знаменитый», «известный». В татарском и башкирском языках это слово имеет именно такой смысл, что указывает на возможные тюркские корни у основателя рода. Если это так, то прозвище давали человеку видному, уважаемому, пользовавшемуся авторитетом.

Суффикс -ов в фамилии — стандартный русский патронимический формант, отвечающий на вопрос «чей?». Он указывает на то, что фамилия формировалась в русской языковой среде, скорее всего, у крещёных татар, башкир или других народов Поволжья, перешедших в православие. Модель «тюркская основа + русский суффикс» — одна из самых распространённых в русском ономастиконе, так появлялись, например, фамилии Аксаков, Булатов, Карамзин.

Есть и другая, менее вероятная версия. В некоторых говорах «намит» могло быть искажением слова «намитень» — так в старину называли наметку, то есть нечто наброшенное сверху, или же намёк. Однако эта гипотеза не подкрепляется устойчивой лексической традицией, в отличие от тюркской, которая имеет прямые параллели в языках соседних народов. Поэтому версия с «известным» или «знаменитым» предком выглядит куда надёжнее.

В дореволюционных метрических книгах фамилия Намитов встречается преимущественно в Казанской, Оренбургской и Уфимской губерниях — как раз в зоне активного смешения славянского и тюркского населения. Это косвенно подтверждает основную гипотезу. Сословно носители фамилии чаще всего были крестьянами или мещанами, реже — купцами, что типично для фамилий, возникших из личных прозвищ, а не из дворянских родов.