Фамилия Наношкина — женская форма фамилии Наношкин. Её основа — не имя и не ремесло, а прозвище, и в этом её отличие от более очевидных фамилий. Разберём словообразовательную модель: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Наношкин), а корень восходит к прозвищу Наношка. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от уличных или бытовых имён, которые давались по внешности, характеру или поведению.

Что могло значить прозвище Наношка? Самая вероятная версия — диалектное слово «наноха» или «наношка», означавшее неряху, неопрятного человека, а иногда — плаксу или капризного ребёнка. В некоторых говорах так называли человека, который «ноет» или «наносит» себе обиду. Прозвище могло закрепиться за тем, кто отличался неряшливостью или излишней обидчивостью. Менее правдоподобна связь с глаголом «наносить» в значении «приносить» — тогда прозвище могло относиться к человеку, который таскает что-либо, но это слабая гипотеза без устойчивой народной традиции.

Географически фамилия редкая и не имеет выраженного ареала. В дореволюционных переписях она изредка встречается в центральных губерниях России, но не фиксируется как дворянская или купеческая. Скорее всего, носители фамилии — потомки крестьян или мещан, у которых прозвище Наношка закрепилось как родовое имя. В современной России фамилия встречается единично, что делает её ценной для генеалогического поиска: найти своих предков по такой фамилии проще, чем по распространённой.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то ближе всего — Нанохин и Наношин. Они образованы от тех же диалектных основ, но с разными суффиксами. Наношкина — вариант с уменьшительным суффиксом -к-, который придавал прозвищу оттенок фамильярности или насмешки. В итоге фамилия несёт в себе память о бытовой среде, где меткое слово могло стать родовым именем на века.