Фамилия Насангужин — редкий образец русской фамилии, сформированной на стыке тюркской и арабо-персидской традиций. Её основа — составное личное имя Насангужа, которое восходит к двум компонентам. Первая часть, «Насан», — это фонетический вариант арабского имени Хасан («красивый», «хороший»), широко распространённого у мусульманских народов. Вторая часть — «гужа» (от персидского «ходжа»), что означает «господин», «хозяин», «наставник» или «купец». В тюркской среде слово «ходжа» часто указывало на духовное лицо, знатока ислама, либо на состоятельного торговца. Таким образом, имя Насангужа можно перевести как «красивый господин» или «почтенный Хасан».

Фамилия образована по русской модели с типичным для Поволжья и Приуралья патронимическим суффиксом -ин. В этом регионе, особенно среди башкир и татар, при оформлении фамилий по-русски часто использовали именно -ин, а не -ов, если основа оканчивалась на -а или мягкий согласный. Насангужин буквально означает «сын Насангужи» или «принадлежащий роду Насангужи». Такая словообразовательная модель — прямое свидетельство того, что предок носителя фамилии был известен под этим составным именем, и его дети и внуки закрепили его как родовое прозвище.

Географически фамилия Насангужин почти наверняка привязана к Башкортостану или к соседним с ним областям (Оренбургская, Челябинская). Среди башкир и татар были распространены двусоставные имена с компонентом «ходжа», например, Ишходжа, Насретдинходжа. Фамилия Насангужин — один из немногих сохранившихся в письменной форме следов такого именования. Социальный статус первых носителей мог быть разным: от сельского муллы до зажиточного крестьянина или купца, но само имя «ходжа» подчёркивало уважение к его обладателю.

В русском языке фамилия сохранила исходное ударение на последний слог основы, как и в тюркском оригинале: Насангу́жин. Если сравнивать её с однокоренными фамилиями, то можно заметить, что вариант Насангужев встречается реже и характерен для регионов, где при русификации предпочитали суффикс -ев. Фамилия Насангужин, с её глухим «ж» и твёрдым окончанием, — более архаичный и точный слепок тюркского произношения.