Фамилия Насаненко — яркий пример восточнославянской модели образования фамилий на -енко, характерной прежде всего для Украины. Суффикс -енко, изначально уменьшительный, в фамилиях превратился в патронимический показатель, означающий «сын», «потомок» или «принадлежащий к роду». Поэтому Насаненко — это буквально «сын Насана» или «человек из рода Насана».

Основа фамилии — личное имя Нисан (Насан) — это одна из форм библейского имени Нисан. В еврейской традиции Нисан — название весеннего месяца, в который празднуют Песах, а также имя, связанное с этим месяцем. Однако в славянской среде, особенно на территориях, где проживали еврейские общины, имя могло быть заимствовано и адаптировано. В украинском языке звук «и» в безударной позиции часто переходил в «а» (аканье), поэтому Нисан превращался в Насан. Таким образом, Насаненко — это украинизированная форма фамилии, указывающая на предка по имени Нисан (Насан).

Версия о происхождении от тюркского или кавказского корня (например, от слова «нас» — «род» или «племя») менее убедительна. Во-первых, суффикс -енко — типично славянский, а не тюркский. Во-вторых, для фамилий на -енко характерна именно славянская основа, пусть и заимствованная. Если бы корень был тюркским, фамилия, скорее всего, оформилась бы иначе (например, Насанов или Насанбеков).

Географически фамилия Насаненко тяготеет к центральным и восточным областям Украины, а также к югу России — регионам, где были сильны украинские переселенческие потоки. Встречается она относительно редко, что указывает на локальное происхождение от конкретного рода. Социальный контекст: носители фамилии, как правило, были крестьянами или казаками, поскольку фамилии на -енко в XVII–XIX веках были распространены именно в этих сословиях, в отличие от дворянских фамилий на -ов/-ев или -ский.

Особенность написания — вариант «Насаненко» с буквой «а» в корне — закрепился в документах, хотя этимологически исходная форма «Нисаненко» (от имени Нисан) встречается реже. Это типичный случай, когда народное произношение вытеснило книжное написание.