Фамилия Наточный — один из тех случаев, когда профессиональное прозвище намертво приросло к роду и пережило само ремесло. Её основа — глагол «наточить» или существительное «наток» (заточка). Вероятнее всего, первый носитель фамилии был точильщиком: натачивал ножи, ножницы, свёрла. В доиндустриальной России точильщик — фигура заметная, ведь рабочий инструмент был дорог и требовал постоянного ухода. Прозвище Точило, Точильщик или Наточный давали не просто по занятию, а по мастерству: «наточный» — тот, кто хорошо натачивает, делает лезвие острым.

Модель образования здесь нестандартная. Обычно фамилии ремесленников оформляли суффиксами -ов/-ев (Кузнецов, Плотников) или -ин (Ткачихин). Суффикс -ый в фамилии Наточный — это адъективная форма, характерная для прозвищ, которые стали фамилиями без изменения: как Толстый, Косой, Грязный. Такой способ типичен для украинской и южнорусской традиции, где прозвище на -ый могло закрепиться в качестве фамилии без прибавления патронимического суффикса. Поэтому фамилия Наточный — скорее южного или западнорусского происхождения, чем северного.

Есть и более редкая версия — связь с диалектным словом «наток» в значении «ручей», «поток» или «натекшая вода». В этом случае Наточный — человек, живущий у ручья или на сырой низине. Но эта гипотеза слабее: фамилии от гидрографических объектов обычно образуются через -ский (Наточский) или через -ин (Наточин), а форма на -ый для таких основ нетипична. Так что основная версия — точильщик.

По сословному составу Наточные, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, а также ремесленниками в городах. В дворянские родословные книги эта фамилия не попала — слишком «низовое» прозвище. Встречается она в основном в Черниговской, Полтавской и Харьковской губерниях, что подтверждает украинский след. В современной России фамилия редкая, но не исчезнувшая: её носители живут в Краснодарском крае, Ростовской области и на юге Центральной России — там, где сохранилась память о малороссийских переселенцах.