Фамилия Нацибулин — редкий случай в русском ономастиконе, где тюркский корень причудливо сочетается с русским суффиксом -ин. В отличие от стандартных фамилий на -ов/-ев, которые образуются от отчеств на -ович/-евич, модель на -ин обычно указывает на основу, оканчивающуюся на гласный или мягкий согласный. Здесь же мы видим основу «Нацибул», которая явно восходит к арабскому имени Наджибулла (Наджиб-Улла), что переводится как «благородный слуга Бога» или «избранный Аллахом». В тюркской среде, особенно у татар и башкир, имя трансформировалось в Нацибулла, а затем, при русификации, потеряло конечный гласный звук и обросло типичным русским патронимическим суффиксом.

Географически фамилия тяготеет к Волго-Уральскому региону — Татарстану, Башкортостану, Оренбургской области. Это указывает на происхождение из среды служилых татар или тептярей, которые в XVII-XIX веках активно контактировали с русским населением и принимали фамилии по русской модели. Встречается также вариант Нацибуллов, но он менее распространён. Интересно, что в некоторых переписях начала XX века фиксировалось написание Нацыбулин, что отражает живое произношение с твёрдым «ц» — характерную черту татарской фонетики, где звук «ц» заменяет мягкое «т» в арабизмах.

Что касается социального статуса, то носители фамилии, скорее всего, не относились к высшему дворянству. Среди татарских мурз и князей были распространены фамилии на -ов (Тенишевы, Акчурины), тогда как -ин чаще встречался у крестьян, мещан и мелких торговцев. Однако полностью исключать привилегированное происхождение нельзя — некоторые татарские роды, перешедшие на русскую службу, получали фамилии именно по такой модели. Письменные источники, например, «Списки населенных мест Российской империи» за 1860-е годы, упоминают деревни в Казанской губернии, где жили Нацибулины, но без указания сословия.

Сегодня фамилия остаётся малочисленной, её носители рассеяны по всей России, но наибольшая концентрация сохраняется в Татарстане и соседних регионах. Встречается она и в Казахстане — среди татарской диаспоры, переселившейся туда в советское время.