Фамилия Наймушин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Наймушин образована от прозвища Наймуша. В его основе лежит глагол «наймать», т.е. «нанимать». Скорее всего, такое прозвище получал наемный работник. Менее вероятной представляется этимологическая связь фамилии с мусульманским мужским именем Наим, которое в переводе с арабского означает «счастье, благоденствие». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Наймуша, со временем получил фамилию Наймушин. О точном месте и времени возникновения фамилии Наймушин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Наймушин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.