Фамилия Назайкинская звучит как типичная «географическая» фамилия, образованная от названия места. Суффикс -ск- указывает на принадлежность к чему-то или происхождение откуда-то, а окончание -ая — на женский род. В современном виде это чаще всего женская форма фамилии; мужской вариант, соответственно, Назайкинский.

Основа фамилии — топоним Назайкино или Назайка. Скорее всего, это название небольшого населённого пункта. На картах встречается несколько деревень с похожими названиями, например, Назайкино в Самарской области. Жителей таких деревень — выходцев оттуда — и прозвали Назайкинскими, то есть «теми, кто родом из Назайкина». Такая модель образования фамилий была особенно распространена в среде духовенства и дворянства в XIX веке, а также у крестьян, переселявшихся в другие губернии.

Само название деревни Назайкино, скорее всего, произошло от прозвища или неканонического имени Назайка. Это уменьшительная форма от имени Назар (от древнееврейского «посвящённый Богу») или от прозвища, связанного с диалектным словом. В некоторых говорах «назайка» могло означать назойливого, навязчивого человека. Вторая версия — происхождение от тюркского корня, где «назай» означало «нежный», «изнеженный», что тоже могло стать прозвищем. Первая версия (от имени Назар) выглядит более вероятной, так как фамилии на -ский от имён — явление редкое, и обычно за ними стоит географическая привязка к деревне, названной по имени первопоселенца.

Таким образом, носительница фамилии Назайкинская может считать своим предком человека по имени Назар (в народной форме Назайка), который основал деревню, или же её предки были выходцами из такой деревни. Фамилия относительно редкая и несёт в себе чёткую региональную привязку, что делает её ценной для генеалогического поиска.