Фамилия Негае — довольно редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять её корни, проще всего начать с её звучания и окончания. Форма на -ае — нехарактерная для русских фамилий, где преобладают -ов, -ев, -ин или -ский. Такое окончание сразу указывает на нерусское, скорее всего, тюркское или кавказское происхождение. В частности, в осетинском, адыгском и некоторых тюркских языках фамилии с таким окончанием (Негае, Карае, Гогае) образованы от личного имени или прозвища предка.

Самая вероятная версия связывает основу Нега- с тюркским словом neg (нег, неке), которое в разных диалектах означает «плохой», «негодный», «слабый». Звучит грубо, но в ономастике это обычное дело: такие «охранительные» имена давали детям, чтобы обмануть злых духов. Считалось, что если назвать ребёнка Плохим (Негай), то духи не позарятся на него, и он вырастет здоровым и сильным. Позже это прозвище закрепилось за родом.

Менее распространённая, но допустимая гипотеза — происхождение от имени Негай, которое могло быть вариантом арабского имени Наги (спасённый, благополучный) или тюркского Ногай (от названия племени ногайцев). В этом случае фамилия означала бы принадлежность к конкретному народу или человеку с таким именем.

Географически фамилия Негае встречается в основном на Северном Кавказе (Осетия, Кабардино-Балкария) и среди ногайцев. В русских документах она могла появиться при записи переселенцев или военных, служивших на Кавказе в XIX веке. Суффикс -ае в таком контексте — это адаптированный к русской письменности патронимический показатель, указывающий на «сына такого-то» (как -ов или -ян у других народов).

Таким образом, фамилия Негае — яркий пример того, как прозвище-оберег или этническое имя закрепилось в качестве родового имени. Предок носителя этой фамилии, скорее всего, жил на Кавказе или в степях Предкавказья, а его имя или прозвище было связано либо с пожеланием выжить (через «плохое» имя), либо с принадлежностью к ногайцам.