Фамилия Некоча — редкий случай, когда прозвище перешло в наследственное имя почти без изменений, минуя типичные суффиксы -ов, -ин или -ский. Её основа — глагол «некочить» или существительное «некоча». В диалектах русского языка «некоча» означала неловкого, неуклюжего человека, того, кто «кочевряжится» — упрямится, делает всё наперекор. В некоторых говорах слово фиксировалось в значении «неповоротливый, медлительный». Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, получил её за характер или манеру поведения.

Словообразовательная модель здесь архаичная: фамилия образована напрямую от прозвища без патронимического суффикса. Это характерно для южнорусских и украинских земель, где фамилии на -а, -я (Некоча, Мазепа, Скряга) встречаются чаще, чем на севере. Встречаемость фамилии крайне низкая, она не входит в списки распространённых русских фамилий и не привязана к известным дворянским родам. Скорее всего, она бытовала среди крестьян или посадских людей в Черниговской, Полтавской или Курской губерниях — регионах, где диалектная лексика активно влияла на прозвища.

Интересно, что фамилия Некоча могла возникнуть и как охранительное имя — так в семье называли ребёнка, чтобы отвратить от него неуклюжесть или упрямство. В народной традиции давали прозвища с отрицанием «не-» в качестве оберега: считалось, что если назвать человека Некочей, он вырастет ловким и покладистым. Эта версия менее вероятна, чем прямая характеристика, но полностью исключать её нельзя — подобные случаи описаны в работах по славянской антропонимии.

Сравните с однокоренными фамилиями: Кочергин, Кочеврягин, Некочевряжин. Все они восходят к той же образной основе — «коче» или «кочеря» (коряга, сук, нечто искривлённое). Некоча — более краткий и прямой вариант, сохранивший исходное прозвище без грамматической обработки.