Фамилия Немолякина — женская форма мужской фамилии Немолякин, и её происхождение напрямую связано с прозвищем, которое давали человеку за особенность характера или поведения. В основе лежит глагол «молять» (устаревшая форма от «молить») или диалектное «молякать» — говорить невнятно, бормотать. Соответственно, «Немоляка» — это человек, который не молится, либо, что вероятнее, тот, кто говорит неразборчиво, «немолякает». Прозвище могло закрепиться за неразговорчивым, молчаливым человеком или, наоборот, за тем, кто бормочет себе под нос.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Немолякин — сын или потомок Немоляки. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ на -а/-я. Форма Немолякина, с окончанием -а, традиционно используется для женщин в русской фамильной системе.

Географически фамилия редкая. Её следы ведут в центральные регионы России, в частности, можно встретить упоминания в документах по Вологодской и Костромской губерниям. В этих краях диалектное слово «молякать» было в ходу, что подтверждает версию о прозвище, связанном с манерой речи.

Стоит отметить, что в отличие от многих фамилий, образованных от церковных терминов (например, Богомолов — тот, кто Богу молится), Немолякин — скорее бытовое, ироничное прозвище. Оно не обязательно означало безбожие: в крестьянской среде так могли назвать упрямца, который не желал участвовать в общем молебне, или просто человека с невнятной дикцией. Фамилия Немолякина — редкий пример того, как отрицательная частица «не» и бытовое слово закрепились в качестве родового имени, не имея при этом резко негативного оттенка, а лишь фиксируя внешнюю или поведенческую особенность предка.