Фамилия Нейно — редкая и неочевидная для русского уха. Её происхождение почти наверняка не славянское, а финно-угорское или прибалтийское, и это сразу выделяет её из ряда типичных русских фамилий на -ов или -ин.

Скорее всего, в основе фамилии лежит финское или карельское слово «neito» (девушка, девица) или его диалектный вариант «neino». В таком случае Нейно — это прозвище, которое мог получить мужчина, чем-то напоминавший девушку: например, юноша с нежной внешностью, безбородый, или, напротив, тот, кто любил ухаживать за девушками. В карельской и финской среде прозвища такого типа — обычное дело, и они легко переходили в фамилии, особенно в XIX веке, когда крестьянам массово присваивали фамилии по прозвищам.

Вторая версия, менее вероятная, но возможная для южных регионов, — связь с тюркским корнем «ней» (нечто новое, чужое). Однако для русской фамилии Нейно эта гипотеза слаба: тюркские фамилии обычно оформляются суффиксами, а здесь мы видим чистую основу, что характерно как раз для прибалтийско-финских фамилий.

Географически фамилия Нейно встречается в основном на северо-западе России: в Карелии, Ленинградской области, а также среди ингерманландских финнов. Встречаются единичные носители в Сибири — туда фамилию могли завезти переселенцы в ходе столыпинской реформы или репрессий 1930-х годов.

Словообразовательно фамилия не имеет русского суффикса — она не склоняется по падежам как типичная русская фамилия (Нейно, Нейно, о Нейно). Это прямо указывает на её иноязычное происхождение: в финском языке фамилии часто оканчиваются на гласный и не меняют форму. Если бы фамилия русифицировалась, она могла бы превратиться в Нейнов или Нейнин, но этого не произошло.

Таким образом, предки современного носителя фамилии Нейно — скорее всего, карелы, финны или ижоры, жившие на территории бывшего Великого княжества Финляндского или Олонецкой губернии. Сама фамилия — это застывшее прозвище, которое когда-то метко описывало человека: «девичий» или «похожий на девушку».