Фамилия Ниези — редкий случай, когда географический корень почти наверняка перевешивает любую другую версию. Она практически не встречается в старых русских переписных книгах и не выводится из славянских прозвищ или крестильных имён. С высокой долей вероятности, Ниези — это русифицированная форма итальянской фамилии Niezi или Niesi, которая восходит к топониму. На севере Италии, в области Ломбардия, существует коммуна Ниези (Niesi). Фамилию мог получить человек, переехавший из этого места, или его потомок, обосновавшийся в Российской империи.

Второй вариант, менее вероятный, но возможный в контексте южных регионов бывшей империи (Бессарабия, Новороссия), — связь с греческой фамилией Νιέζης (Niezis). Греческие переселенцы в XIX веке нередко меняли окончания на русский лад, и -ис легко превращалось в -и. В этом случае основа могла быть либо топонимической (от названия местности), либо прозвищной от греческого νιέζω — «наклоняться, кланяться», что могло дать ироничное прозвище «угодник» или «услужливый».

Суффикс -и в русской фамилии нестандартен. Он не указывает на принадлежность отцу (как -ов/-ев или -ин), а скорее фиксирует исходную иноязычную форму без переделки. Это характерно для поздних фамилий, которые записывали со слов носителя без адаптации под привычную славянскую модель. В польской и белорусской традиции такой суффикс мог бы означать «сын» (как в фамилиях типа Костюшко или Мицкевич), но для Ниези это маловероятно — слово не имеет славянской основы.

По сословному происхождению сказать почти нечего. Если это итальянский след, то носители могли быть архитекторами, мастерами-строителями, художниками или торговцами, приглашёнными в Россию в XVIII–XIX веках. Если греческий — то купцами или моряками. Фамилия остаётся редкой и локальной, не размытой по всей стране.

Таким образом, основная версия — итальянская топонимическая фамилия, занесённая в Россию миграцией. Альтернатива — греческое прозвище, переоформленное под русское произношение. Обе гипотезы сходятся в одном: фамилия Ниези — не местного, восточнославянского происхождения, а пришлая, и её носители — потомки выходцев из Средиземноморья.