Фамилия Нифадоф — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Первое, что бросается в глаза, — необычное окончание «-оф». В русских фамилиях стандартная форма — «-ов» (Никитин, Петров). Форма «-оф» — это старая орфография, которая закрепилась в написании до реформы 1918 года, когда в конце слов писали «ъ» и могли передавать звук [в] через «ф» в слабой позиции. Так что Нифадоф — это на самом деле Нифадов. Такое написание встречается у фамилий, которые записывали в документах до революции, и потом носители сохранили эту форму, не «исправив» её на современный лад.

Основа фамилии — Нифад. Здесь, скорее всего, искажённое или диалектное произношение имени Никита. В народной речи имя Никита могло звучать как Нифан, Нифит или, с протетическим звуком, Нифад. Сравните: от имени Никита образованы фамилии Никитин, Никитов, Никитский. А Нифадов — вариант, который возник в говорах, где «к» перед гласной могло смягчаться или заменяться на «ф» (так называемое фрикативное произношение). Менее вероятно, но возможно, что основа восходит к греческому слову «нифада» (снежинка) — но для русской фамильной традиции это экзотично, и скорее всего, имя крестильное.

Таким образом, предок человека с фамилией Нифадоф (Нифадов) — это, вероятно, крестьянин или мещанин, которого в быту звали Нифад, то есть Никита. Фамилия закрепилась в форме с «-оф» в тех губерниях, где писарь или сам носитель придерживался старого правописания. Встретить такую фамилию можно в документах XIX века на севере и северо-востоке России, где сильны были архаичные говоры и где фамилии часто записывали «на слух», с местными особенностями.