Фамилия Нифадов — редкий пример, где основа, скорее всего, не русская, а греческая или арабская, а вот суффикс — чисто русский, патронимический. Разбираем по частям: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — Нифадов, то есть сын Нифада). Значит, в основе лежит личное имя или прозвище Нифад.

Откуда взялось имя Нифад? Здесь возможны два пути, и оба ведут к заимствованиям.

Первая и самая вероятная версия — через греческую церковную традицию. Имя Нифонт (от греч. nēphōn — «трезвый», «рассудительный») в простонародном произношении могло дать формы Нифат, Нифад. Святой Нифонт, епископ Кипрский, был известен на Руси, и его имя встречалось в святцах. Фонетический переход «нт» в «д» (Нифонт → Нифод → Нифад) для русских говоров не редкость: так фамилия Нифонтов могла превратиться в Нифадов через промежуточную форму.

Вторая версия — арабское или тюркское происхождение. Имя Нифад или Нефад могло быть вариантом арабского Нафид (نافذ — «проникающий», «действенный») или Нифа (с прибавлением тюркского аффикса -ад). В мусульманских регионах Поволжья или Кавказа такое имя могло бытовать, а затем, при переходе в православие или при записи в русских документах, получить славянский суффикс -ов. Эта версия слабее, потому что фамилия Нифадов почти не встречается в татарской или башкирской среде, где такие заимствования обычно сохраняют восточный облик.

Географически фамилия тяготеет к югу России и Украине. Встречается в документах по Курской, Воронежской областям и Краснодарскому краю. Это косвенно подтверждает греческую версию: именно в этих регионах, где сильно влияние греческой и малороссийской традиции, имя Нифонт могло дать необычную форму.

Интересная деталь: при всей редкости фамилии у неё есть «двойник» — Нифадов. Вариант с буквой «а» во втором слоге (Нифатов) встречается чаще и прямо указывает на имя Нифат, которое тоже могло быть производным от Нифонта. Так что Нифадов — это, скорее всего, более искажённый, «обкатанный» в быту вариант.