Фамилия Нифака — редкий случай, когда прозвище или имя сохранилось почти без изменений, не обрастая типичными русскими суффиксами -ов или -ин. Сама основа звучит нехарактерно для славянского уха, и это сразу подсказывает направление поиска.

Скорее всего, в основе фамилии лежит тюркское имя Нифак или Нифат. В тюркских языках корень «нифак» восходит к арабскому «нифак» (نفاق) — лицемерие, двуличие. В исламской традиции это слово имеет резко отрицательный смысл, обозначая качество, осуждаемое в человеке. Однако давать ребёнку «предохранительное» имя с плохим значением (чтобы отогнать злых духов или сглазить) — известный обычай у многих народов. Вполне вероятно, что предок носителя фамилии получил такое имя именно по этой логике.

Другая, менее вероятная версия — связь с греческим именем Никифор (Νικηφόρος — «несущий победу»). В народной речи оно могло сократиться до формы Нифака, а затем закрепиться как фамилия. Но против этого говорит то, что фамилии на -ака в русской среде обычно образовывались от прозвищ, а не от полных канонических имён.

Фамилия Нифака не склоняется по падежам как типичная русская фамилия, что тоже указывает на её позднее закрепление или нерусское происхождение. Географически она может быть связана с регионами Поволжья или Северного Кавказа, где было сильно тюркское влияние. В дореволюционных метрических книгах такая фамилия практически не встречается, что говорит о её крайней редкости и, возможно, недавнем возникновении — в XIX–XX веках, когда крестьянам массово давали фамилии по прозвищам.

Сравните с однокоренными фамилиями вроде Нифатов или Нифакин — они встречаются чаще и яснее показывают словообразовательную модель. Нифака же осталась «голой» основой, без суффикса принадлежности, что делает её особенно интересной для этимолога.