Фамилия Нигеров — один из тех случаев, когда внешнее звучание обманчиво, а корень лежит совсем не там, где можно подумать. В русском языке она образована не от названия цвета или народа, а от имени или прозвища Нигер. Это имя пришло из латинского «niger» — «чёрный», но в дореволюционной России его давали не по цвету кожи, а по тёмным волосам, смуглому лицу или просто как иноческое имя.

В православных святцах есть святой Нигер, упоминаемый в Новом Завете (Деяния апостолов, 13:1). Имя это встречалось в монашеской среде, а позже перешло в прозвища. Поэтому предки Нигеровых могли быть либо людьми с очень тёмной внешностью (чернявые, смуглые), либо выходцами из духовного сословия, где такие имена давали при постриге.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую модель: «чей?» — Нигеров, то есть сын Нигера. Фамилия редкая, в основном встречается в центральных областях России и на юге, где было больше контактов с греческим и латинским влиянием через церковные книги. Никакого отношения к современному политизированному значению слова «нигер» она не имеет — это чисто русское образование от личного имени, которое в старину звучало нейтрально.

Стоит заметить, что в некоторых случаях фамилия могла возникнуть и от прозвища, данного за черную работу или за занятие, связанное с сажей, углём, но версия с личным именем Нигер — основная и подтверждается ономастическими источниками. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» подобные образования от латинских корней упоминаются как характерные для семинарской среды, где любили давать фамилии «по-учёному».