Фамилия Ниипёт — один из тех редких случаев, когда написание почти полностью совпадает с тем, как её слышат. Она явно финского или карельского происхождения, и в ней сразу узнаётся финское слово «niitty» (луг). Исходная форма, скорее всего, была Niittypää (буквально «луговая голова» или «верхушка луга») или Niittynen (уменьшительное от «луг»). При переходе в русскую среду длинное и неудобное для произношения сочетание согласных упростилось, а конечное -nen или -pää редуцировалось до короткого -ёт, которое на слух воспринималось как окончание.

Географически фамилия привязана к территориям бывшей Ингерманландии (Ленинградская область) или Карельского перешейка, где в XVIII–XIX веках активно шёл процесс русификации финских и карельских фамилий. Писарь или переписчик, не зная финского, записывал фамилию со слов хозяина: «Ниипёт» — это буквальная транскрипция того, что он услышал.

Модель образования здесь необычна для русской ономастики: в ней нет типичных суффиксов -ов, -ин или -ский. Фамилия застыла в форме, близкой к исходному прозвищу или географическому названию. Предки носителя фамилии, вероятно, жили на лугу, владели лугом или происходили из деревни с похожим названием (в Финляндии и Карелии есть топонимы Niittylä, Niittysaari).

Среди однокоренных фамилий, которые встречаются в России, — Ниитинен, Нийт, Нийтти. Но Ниипёт стоит особняком: она почти не даёт вариантов для склонения и сразу выдает финно-угорские корни. Это не искусственно созданная фамилия, а живой след переселения и языкового контакта, где сложное слово сжалось до пяти букв.