Фамилия Нинаженков — довольно редкая и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы разобраться, стоит отбросить суффикс -ов, который указывает на принадлежность («чей?» — сын Нинаженка), и присмотреться к основе «Нинаженк». Скорее всего, перед нами не имя, а прозвище, образованное от глагола или прилагательного.

Наиболее правдоподобная версия связывает фамилию с диалектным словом «нинажить» или «нанажить». В некоторых южнорусских и украинских говорах «нанажить» означало «нажить, приобрести», часто с оттенком усилия или даже хитрости. Прозвище Нинаженок мог получить человек, который что-то «нажил» не совсем честным путём, или, наоборот, удачливый хозяин, сумевший сколотить состояние. Суффикс -енок (в форме -енк) характерен для восточноукраинских и южнорусских фамилий и часто указывает на молодого человека или сына: Нинаженок — сын Нинажнего или просто «малый Нинага».

Менее вероятная, но возможная версия — искажение от «ненажённый» (ненадёванный, новый) или от имени Нинаж, которое могло быть сокращённой формой от канонического имени Аннин (Анна) или Никандр, но такое объяснение выглядит натянутым из-за нехарактерного звучания.

Географически фамилия Нинаженков встречается в основном в Курской, Белгородской и Воронежской областях, а также на востоке Украины — в Сумской и Харьковской областях. Это подтверждает связь с южнорусским и украинским языковым ареалом, где суффикс -енок продуктивен. Сословно носители фамилии, скорее всего, были крестьянами или однодворцами — потомками служилых людей, охранявших южные границы.

Таким образом, фамилия Нинаженков — это отчество от прозвища, которое могло характеризовать человека по его отношению к труду, наживе или имуществу, и имеет чёткую региональную привязку к чернозёмным областям.