Фамилия Нипане — случай, когда географический ключ важнее морфологического. Она почти наверняка происходит из Прибалтики или исторических земель Ливонии. В основе лежит латышское или литовское прозвище, а не славянское имя. Если разбирать словообразовательную модель, то суффикс -е в русской передаче указывает на окончание, характерное для фамилий балтийского происхождения, особенно латышского (сравните: Берзиньш, Калныньш, но в русифицированной записи часто теряют суффикс -иш и остаётся основа на -е). В Латвии фамилии с окончанием -е, -а, -ис — женского рода, но при переносе в русскую среду грамматический род застывает, и фамилия становится общей для мужчин и женщин.

Основа «Нипан-» восходит к латышскому слову «nīpa» или «nīpans». В латышском языке «nīpa» означает «вялый», «медлительный», «флегматичный». Прозвище могли дать человеку с неторопливым характером, неспешного в работе или в движениях. Альтернативная, но менее вероятная версия — от литовского «nypas», что значит «кончик», «остриё», и тогда прозвище могло относиться к острому носу или подбородку. Однако в балтийской ономастике прозвища по чертам характера встречаются чаще, чем по деталям внешности.

Географически фамилия Нипане встречается почти исключительно в Латвии, в исторических регионах Курземе и Земгале. В России и Украине она редкая и, скорее всего, принадлежит потомкам латышских переселенцев времён Столыпинской аграрной реформы или репрессий 1940-х годов. Никакого отношения к славянским корням «нип-» (которого в русском языке нет) фамилия не имеет, и попытки вывести её от слова «нипать» или «нипель» — ошибочны.

Социальный контекст простой: носители фамилии — потомки латышских крестьян или батраков. Фамилии с суффиксом -е в Латвии часто встречались у безземельных или малоземельных крестьян, в отличие от фамилий на -с (мужской род), которые могли носить зажиточные хозяева. Никакого дворянского или купеческого происхождения у Нипане нет.