Фамилия Нишкомаев является самобытным памятником славянской культуры. Фамилия Нишкомаев образована от прозвища Нишкомай. В его основе, скорее всего, лежит украинский глагол «нишкати», который в переводе означает «разузнавать, разыскивать». Вполне вероятно, что это прозвище отражало особенности характера и поведения предка (любопытство, хитрость, ловкость). Согласно другой гипотезе, прозвище ведет свое начало от русского слова «нишкнуть», то есть «не молвить ни словечка, молчать». В таком случае можно предположить, что основатель рода Нишкомаевых был неразговорчивым человеком. Так и прозвище Нишкомай закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Нишкомаев. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Нишкомай, со временем получил фамилию Нишкомаев. Безусловно, фамилия Нишкомаев представляет собой замечательный памятник славянской культуры. Однако процесс формирования каждой отдельной фамилии мог быть длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Нишкомаев можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.