Фамилия Нивакшонова — редкая и нестандартная для русского уха. Её основа, скорее всего, не славянская, а заимствованная или искусственно образованная. В ней нет привычных русских корней, указывающих на ремесло или внешность. Самая вероятная версия: фамилия происходит от географического названия или личного имени, распространённого в регионах Средней Азии или Кавказа.

Разберём словообразовательную модель. Суффикс -ов- (в женском роде -ова) типичен для русских фамилий, образованных от имён или прозвищ. Но основа «Нивакшон» не имеет очевидной этимологии в русском языке. Можно предположить, что это искажённая или адаптированная форма тюркского или иранского имени. Например, «Нива» может восходить к таджикскому или персидскому слову, означающему «половина» или «середина» (ним, нима), а «кшон» — к «кишан» или «кашан» (название местности или рода). Вместе это могло быть прозвищем человека из определённого селения или рода. Вторая версия, менее правдоподобная, — что фамилия образована от редкого дохристианского имени Нивакша, которое могло бытовать в среде староверов или в северных говорах, но для этого нет надёжных лингвистических подтверждений.

С точки зрения географии, фамилия Нивакшонова почти не встречается в центральных областях России. Её носители, по данным открытых источников, сосредоточены в республиках Средней Азии (Таджикистан, Узбекистан) и в южных регионах России, куда происходили миграции в советское время. Это указывает на то, что предки человека с такой фамилией могли быть выходцами из горных или предгорных районов, где в ходу были сложные составные имена. Суффикс -ов- в данном случае — поздний «обруситель», который добавили при записи в паспорт или метрику, чтобы фамилия вписалась в общероссийскую систему.

Социальный контекст здесь скорее бытовой: фамилия могла закрепиться за переселенцами или за рабочими, которые приехали на стройки или заводы в советские годы. Никакого дворянского или купеческого происхождения у неё нет — это поздняя, «народная» фамилия, возникшая в XX веке через адаптацию местного имени. Если искать однокоренные аналоги, то ближе всего будут фамилии вроде Нивакшонов (мужской вариант) или Нивакшон, без окончания, что встречается у народов, где отчества не использовались. Споров среди ономастов по этой фамилии нет — слишком она редкая, чтобы попасть в академические словари.