Фамилия Ногинов, на первый взгляд, кажется прозрачной: «нога» и суффикс -ов. Однако такой прямой путь — от части тела — в русских фамилиях почти не работает. Прозвища по ногам (Кривоног, Долгоног) действительно существовали, но они давали основу для фамилий вроде Кривоногов или Долгоногов. Форма «Ногин» (без суффикса -ов) встречается чаще, и она как раз могла означать «тот, у кого ноги — особая примета». Ногинов же выглядит как вторичное образование: либо отчество от прозвища Ногин, либо вариант, где суффикс -ов добавили к основе «Ногин» для уточнения принадлежности.

Есть и более вероятная версия, связанная с географией. В центральной России, особенно в рязанских и владимирских землях, фамилии с суффиксом -инов нередко образовывались от названий деревень на -ино: Ногино, Ногинка. В этом случае Ногинов — это «выходец из Ногина». Таких селений в России несколько, и они, скорее всего, получили имя от первопоселенца по прозвищу Нога. То есть фамилия Ногинов — не про «ногу» напрямую, а про человека, который жил в месте, названном в честь кого-то с такой приметой.

Интересно, что фамилия Ногинов встречается значительно реже, чем Ногин. Это говорит о том, что она могла возникнуть в среде, где была сильна традиция полной отческой формы: не просто «сын Ноги», а «сын Ногина». В документах XVII–XVIII веков подобные фамилии фиксировались у крестьян и однодворцев южных уездов — там любили многоступенчатые суффиксы. Так что предки Ногиновых, скорее всего, были не боярами и не дворянами, а свободными или владельческими крестьянами, которых записывали по деревне или по отцу.

Спорный момент: могла ли фамилия быть связана с тюркским словом «ногой» (ногаец)? Теоретически да, но для этого основа должна была звучать как «Ногай», а суффикс -инов здесь нехарактерен. Версия с «ногайцем» маловероятна и держится только на внешнем сходстве звучания.