Фамилия Ноняк — редкая, но прозрачная по происхождению. В её основе лежит прозвище или имя Ноня. В русских говорах, особенно северных и сибирских, «ноня» — это нытик, плакса, капризный человек. Слово образовано от глагола «ныть» через характерный для разговорной речи суффикс -н-: ныть → ноня (с чередованием ы/о). Такие прозвища давали ребёнку, который часто хныкал, или взрослому с меланхоличным, жалобным характером.

Суффикс -як в фамилии Ноняк указывает на принадлежность: буквально «сын Нони» или «человек из рода Нони». Эта модель типична для украинских, белорусских и южнорусских фамилий (ср. Гончар — Гончарук, Бондарь — Бондаренко, а также Ноняк, Доняк, Воняк). Впрочем, -як встречается и в западнославянских фамилиях, так что географию бытования Ноняк стоит искать на стыке русских и украинских земель — в Брянской, Смоленской, Курской областях или на востоке Беларуси.

Есть и другая, менее вероятная версия: от украинского слова «ноня» (нянька, кормилица). В этом случае прозвище могло закрепиться за заботливым человеком или тем, кто работал с детьми. Но в ономастике первое значение — нытик — считается основным, потому что прозвища по характеру давали чаще, чем по профессии.

Известных носителей фамилии Ноняк в истории нет — это говорит о том, что фамилия оставалась локальной, крестьянской, не попала в дворянские родословные книги. По переписям XIX века её можно встретить в единичных записях по Черниговской и Могилёвской губерниям. Сегодня фамилия встречается редко, в основном в России и на Украине, и сохраняет связь с древним прозвищем, которое когда-то дали человеку за его манеру жаловаться на жизнь.