Фамилия Нугербекова — женская форма, а мужская, Нугербеков, в свою очередь, принадлежит к распространённому типу тюркских фамилий, образованных от личного имени. В основе лежит сложносоставное имя Нугербек, которое восходит к двум тюркским корням: «нугер» (нукер) и «бек».

Слово «нукер» (нугер) в монгольских и тюркских языках исторически означало «друг», «товарищ», а в военной иерархии — «дружинник», «воин из личной гвардии» хана или знатного лица. Второй компонент, «бек», — это титул, обозначающий князя, господина, предводителя. Таким образом, имя Нугербек дословно можно перевести как «князь-друг» или «воин-господин», что звучит как почётное прозвище для верного соратника или военачальника.

Фамилия образована по стандартной для казахских и других тюркских народов модели: к основе имени Нугербек добавляется русский патронимический суффикс -ов, а затем — окончание -а, указывающее на женский род. Такая модель (имя + -ов/-ев) закрепилась в XIX–XX веках в рамках делопроизводства Российской империи и советского учёта, когда тюркские имена стали оформлять по русскому образцу.

Географически фамилия Нугербекова наиболее характерна для Казахстана, особенно для южных и западных регионов, где распространены родовые имена с компонентом «бек». Встречается она и среди киргизов, а также у некоторых народов Северного Кавказа, где аналогичные имена бытовали в среде знати и воинского сословия.

Споров о происхождении этой фамилии практически нет: корни прозрачны, а значение имени-основы не вызывает разночтений. Единственное, что может варьироваться, — это написание в дореволюционных документах: иногда встречается вариант «Нукербеков» или «Нугербеков» с одной «г», что связано с особенностями передачи тюркского звука «к» на письме.