Фамилия Нухаева — женская форма фамилии Нухаев, и её происхождение напрямую связано с мужским именем или прозвищем Нухай. В основе, скорее всего, лежит тюркское имя Нухай, которое представляет собой один из вариантов библейского и коранического имени Ной (араб. Нух). В исламской традиции пророк Нух почитается как один из первых посланников Аллаха, и производные от его имени формы широко распространены у народов Кавказа и Поволжья.

Словообразовательная модель здесь проста и типична для русских фамилий: к основе Нухай добавляется патронимический суффикс -ев, указывающий на принадлежность («чей?» — сын Нухая). Ударение в фамилии, как правило, падает на второй слог: Нуха́ева, что характерно для фамилий, образованных от имён с конечным -ай. Встречаются варианты написания через «о» — Нохаева, но они менее частотны и могут отражать местные диалектные особенности произношения.

Географически фамилия Нухаева почти наверняка имеет чеченское или ингушское происхождение. Имя Нухай (или Ноха) — традиционное для вайнахских народов, и фамилии с этим корнем (Нухаевы, Нохаевы) распространены в Чечне, Ингушетии, а также среди чеченской диаспоры. Встречаются они и у соседних народов Дагестана, но основной ареал — именно Северный Кавказ. Таким образом, предок носительницы этой фамилии был человеком, которого звали Нухай, либо его отца так звали, и со временем это личное имя закрепилось в качестве родового прозвания, перейдя в официальную фамилию.

Среди однокоренных фамилий можно назвать Нухаев, Нухай, Нухайкаев, а также более редкую форму Нухайшвили, встречающуюся у грузин чеченского происхождения. Все они восходят к одному корню, но различаются по способу оформления: русским суффиксом -ев, тюркским окончанием -ай или грузинским -швили. В русском языке фамилия Нухаева склоняется по правилам прилагательных женского рода, и в документах её форма не меняется в зависимости от контекста.