Фамилию Нухашкеева можно разобрать, только если увидеть её в контексте калмыцкой или тюрко-монгольской ономастики. В русском языке она выглядит как искусственная или редкая, но за ней стоит живая модель образования фамилий у народов, исповедующих буддизм и говорящих на языках ойратской группы.

Основа фамилии — слово «нухашк» или близкие к нему варианты. В калмыцком языке «нухашк» означает «нора» или «ямка», но в переносном смысле могло обозначать прозвище человека, который живёт уединённо, прячется, либо того, кто роет землю (например, землекопа или охотника, добывающего сурков). Суффикс «-еев» (а в женском варианте «-еева») — типичный для калмыцких фамилий, русифицированный в XIX–XX веках при записи в метрики и паспорта. Первоначальная форма, скорее всего, звучала как Нухашке или Нухашкин, а окончание «-а» в русском языке закрепилось по аналогии с женскими фамилиями на «-а».

Главная особенность фамилии — двойной суффикс «-шк-», который редко встречается в русских фамилиях, но характерен для калмыцких уменьшительно-ласкательных форм. То есть «Нухашк» — это не просто «нора», а «норка» или «норушка». Такое прозвище могли дать ребёнку, который любил прятаться в укромных местах, либо взрослому с маленьким ростом или скрытным характером. В отличие от русских фамилий, где корень «Нух-» почти не встречается, у калмыков и бурят подобные основы — обычное дело.

Географически фамилия Нухашкеева привязана к Калмыкии и, возможно, к приграничным районам Астраханской области и Ставрополья. Встречается она редко — носителей насчитывается, по открытым данным, не более нескольких сотен человек. Это говорит о том, что фамилия не разошлась широко и сохранилась в пределах одного рода или небольшой группы семей.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Нухаев, Нухашев — показывает, что основа «нух» (нора, яма) встречается у чеченцев и ингушей, но там суффиксы другие. У калмыков же форма с «-шк-» уникальна: она указывает не на профессию или отчество, а на прозвище по бытовой или поведенческой черте. Таким образом, предок носителя фамилии Нухашкеева, скорее всего, получил своё прозвище в кочевой среде, где меткое слово закреплялось за человеком на всю жизнь, а затем перешло в официальную фамилию при советской паспортизации.