Фамилия Някси — редкая и необычная для русского уха. Её происхождение напрямую связано с географией: это прозвище, ставшее фамилией, которое человек получил по месту жительства или временного пребывания. Основа фамилии — топоним Няксимволь (или Някси), название посёлка в Ханты-Мансийском автономном округе, на реке Северная Сосьва. В этом названии отчётливо слышен коми-зырянский или мансийский след: «няк» в некоторых финно-угорских языках может означать «гнилой» или «болотистый», а «сим» — «река». Таким образом, исходное значение — «житель с гнилой (болотистой) реки» или «пришедший из Няксимволя».

Модель образования фамилии проста: застывшая форма топонима без каких-либо русских суффиксов (-ов, -ин, -ский). Такое прямое заимствование названия в качестве фамилии — характерная черта для сибирских и уральских регионов, где в XIX — начале XX века переписчики фиксировали людей «по месту», не добавляя окончаний. Фамилия Някси могла закрепиться за крестьянином, охотником или рыбаком, который переселился из одноимённого селения в другую волость, или за коренным жителем того же посёлка, которого записали по названию родного места.

Суффикса нет, окончание -и — не русский падежный показатель, а часть основы. Это делает фамилию несклоняемой в мужском и женском вариантах: «Иван Някси», «Анна Някси», «говорить о Някси». Встречаются ли случаи, когда фамилия происходит от личного имени? Теоретически возможно, если в каком-то говоре «Някси» было прозвищем от диалектного глагола со значением «ныть» или «капризничать» (ср. «нянчить», «някситься» в северных говорах), но эта версия менее убедительна: топонимическое объяснение опирается на реальный географический объект и подтверждается бытованием фамилии именно в Приобье.

Поскольку фамилия редкая, известных исторических носителей в публичном доступе нет. Сословная принадлежность предков — вероятнее всего, государственные крестьяне или инородцы (ханты, манси, коми), занимавшиеся охотой и рыболовством. Фамилия не имеет отношения к дворянству или духовенству — в тех средах использовали более стандартные модели на -ский.

Коротко: Някси — это «географический» отпечаток, указывающий на конкретное место в таёжном Зауралье. Предок, скорее всего, был выходцем с берегов Северной Сосьвы, и его прозвище со временем стало наследственной фамилией.