Фамилия Обеев — редкий случай, когда при взгляде на суффикс можно споткнуться. Обычно фамилии на -ев образуются от основ, оканчивающихся на мягкий согласный или на -й: отсюда Иванов, но Алексеев. Обеев же оканчивается на -еев, что наводит на мысль об основе, заканчивавшейся на -ей. Проще всего представить, что в основе лежало личное имя или прозвище Обей. Такое имя могло быть вариантом крестильного имени Авдей (от древнееврейского Овадья — «слуга Бога»), где начальное «Ав» в просторечии потерялось, а «д» перешло в «б» — звуковой переход, обычный для живой речи. Тогда Обеев — буквально «сын Обея».

Есть и вторая, не менее правдоподобная версия. В тюркских языках, особенно в башкирском и татарском, встречается имя или прозвище Убей/Обей, связанное с глаголом «убивать» или с понятием «смерть». В русской среде его могли переоформить по славянской модели: Обей → Обеев. Такое прозвище давали воину или человеку с суровым нравом, а в некоторых диалектах — даже ребенку как имя-оберег, чтобы злые духи думали, что он «мертвый», и не трогали.

География фамилии подсказывает, что обе версии могут работать одновременно. Обеевы встречаются и в центральной России, и в Поволжье, и на Урале. В первом случае скорее сработала народная переделка церковного имени, во втором — тюркское влияние, которое было сильным в регионах смешанного населения. Определить точный источник без генеалогического исследования конкретной семьи невозможно, но обе версии укладываются в общую логику русской фамильной системы.

Словообразовательная модель здесь простая: русский суффикс принадлежности -ев прирос к основе Обей, которая сама по себе уже была готовым именем или прозвищем. Никаких дополнительных суффиксов вроде -ин или -ский фамилия не получила, что указывает на её относительно позднее оформление — в XVII–XVIII веках, когда такие «простые» патронимы становились наследственными фамилиями у крестьян и посадских людей.