Фамилия Охеркин — редкий пример, где фамильный суффикс -ин указывает не на родство по отцу (чей? — Охеркин), а на прозвище, которое закрепилось за человеком. Основа фамилии — «охерка», слово, которое в русских народных говорах имело два значения: либо «охрипший человек» (от глагола «охрипнуть»), либо, что вероятнее, прозвище, связанное с диалектным «охерять» — бить, колотить, ругать. В таком случае Охеркой могли назвать задиру, драчуна или, наоборот, человека, который часто бранился.

Суффикс -ин в этой фамилии необычен: обычно он присоединяется к основам на -а, -я (Петров — Петин, Кузьма — Кузьмин). Здесь же основа «Охерк-» — от «охерка», то есть прозвище уже было в краткой форме, и фамилия буквально означает «сын Охерки» или «человек из семьи Охерки». Такая модель встречается реже, чем -ов/-ев, и характерна для северных и центральных областей России, где прозвища на -ка были особенно распространены.

Географически фамилия крайне редка. В дореволюционных источниках и современных базах данных она почти не встречается, что говорит о её локальном бытовании, возможно, в одной-двух губерниях. Скорее всего, предки носителя фамилии были крестьянами или посадскими людьми, а прозвище закрепилось за конкретной семьёй и не распространилось широко.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Охрипкин, Охрименко, Охримов) показывает, что корень «охр-» чаще связывают с охриплостью или именем Охрим (Ефрем в просторечии). Но Охеркин стоит особняком: в нём нет мягкого «рь», а есть твёрдый «р» и суффикс -к-, что указывает не на имя, а на прозвище. Поэтому версия с драчливым характером или привычкой ругаться выглядит убедительнее, чем производное от канонического имени.

Фамилия не имеет дворянского происхождения — в родословных книгах она не зафиксирована, и её носители, если судить по скудным данным, были простыми людьми. Известных публичных личностей с такой фамилией нет, что только подчёркивает её редкость и узкую региональную привязку.